เมื่อวันที่ 19 ตุลาคม 2563 นายสุวรรณ ทวีผล ผู้อำนวยการโรงเรียนเบญจมราชูทิศ จังหวัดจันทบุรีได้ออกประกาศเรื่อง การหยุดเรียนเป็นกรณีพิเศษ เนื่องจากโรงเรียนได้รับแจ้งว่าในวันอังคารที่ 20 ตุลาคม 2563 เวลา 16.00 น. เป็นต้นไป มีการนัดหมายรวมตัวกันบริเวณหน้าโรงเรียน เพื่อความปลอดภัยของนักเรียนและหลีกเลี่ยงปัญหาที่อาจเกิดขึ้นได้
ตามระเบียบกระทรวงศึกษาธิการ ว่าด้วยการเปิดและปิดสถานศึกษา พ ศ. 2549 ที่แก้ไขเพิ่มเติมฉบับที่ 2 พ.ศ. 2558 ข้อ 9 (1) โรงเรียนจึงขอแจ้งปิดสถานศึกษาเนื่องจากเหตุพิเศษในวันอังคารที่ 20 ตุลาคม 2563 จำนวน 1 วัน เพื่อระงับเหตุ หรือ เพื่อป้องกันภยันอันตรายอันอาจจะเกิดขึ้น
ทั้งนี้โรงเรียนดำเนินการจัดการเรียนการสอนออนไลน์ให้กับนักเรียนเรียน Onlne ตามตารางเรียน และเปิดทำการเรียนการสอนตามปกติ ในวันพุธที่ 21 ตุลาคม 2463 หากมีการเปลี่ยนแปลงจะแจ้งให้ทราบต่อไป